В 1992 году Филармоническое общество было возрождено усилиями ряда видных общественных деятелей Санкт-Петербурга, в число которых вошли: академик Дмитрий Лихачев, художественный руководитель Санкт-Петербургской академической филармонии Юрий Темирканов, музыковед Михаил Бялик, председатель правления банка «Санкт-Петербург» Юрий Львов, а также председатель Союза композиторов Санкт-Петербурга Андрей Петров, возглавивший возрожденное Общество.

Основными направлениями работы Общества являются: организация и проведение симфонических, камерных и хоровых концертов, различных фестивалей и праздников, издание книг и пособий, посвященных актуальным вопросам музыкального искусства, а также поддержка юных музыкантов – учащихся музыкальных школ Санкт-Петербурга.

Начиная с 1995 года, в рамках программы «Классика и будущее», принятой Филармоническим обществом совместно с Комитетом по культуре Санкт-Петербурга и банком «Санкт-Петербург», Общество ежегодно учреждает 15 стипендий, ежемесячно выплачиваемых банком наиболее одаренным юным музыкантам. За 12 прошедших лет стипендиатами Общества и банка стали без малого 100 учащихся музыкальных школ города. Имена же таких стипендиатов, как И. Грингольц, М. Култышев, Е. Фролова, А. Коробкина, А. Дмитриева, А. Григорьев, С. Климашевский приобрели не только российскую, но и международную известность.

За 15 лет своего нового существования Филармоническое общество провело 240 симфонических и камерных концертов, в которых прозвучали сочинения более ста российских и зарубежных композиторов. В эти годы Общество организовало целый ряд музыкальных циклов и фестивалей, ставших заметными событиями в музыкальной жизни Петербурга, в том числе: цикл концертов «Почетные члены Санкт-Петербургского Филармонического общества» (1993/1994), фестиваль «Шумановские дни в Санкт-Петербурге» (1994/1995), цикл «Венок для Вены» (1997/1998), цикл «В отраду оставшимся» (2000/2001), фестиваль «Андрей Петров в кругу друзей» (2000), фестиваль музыки С.М. Слонимского (2000). С 2001 года Общество стало принимать активное участие в организации и проведении фестиваля Союза композиторов Петербургская музыкальная весна>, а с 2004 года – в проведении фестиваля «Земля детей».

К своему 200-летнему юбилею Общество выпустило капитальный труд, посвященный истории и современному состоянию Общества, и отвечающий практически на все вопросы, связанные с его деятельностью. Кроме того, в дни празднования своего юбилея Общество провело специальный фестиваль «Классика и будущее», удостоенный Диплома за лучший международный музыкальный проект года в Петербурге.

Крупными событиями последних пяти лет стали: фестиваль музыки Андрея Петрова "Сотворение мира продолжается" (2005), ряд монографических циклов, в том числе: «Все Концерты для фортепиано с оркестром Рахманинова» (2004), «Все произведения Листа для фортепиано с оркестром», «Все Концерты Моцарта для скрипки с оркестром» (2005), «Все сонаты для фортепиано и скрипки Бетховена» (2006), цикл концертов в Вене, Праге и Братиславе «Петербургские сезоны в европейских столицах», цикл концертов, посвященных 100-летию Д. Шостаковича.

До февраля 2006 года Президентом Филармонического общества являлся замечательный петербургский композитор Андрей Павлович Петров. После его неожиданной кончины Общество возглавил Борис Леонидович Березовский, со дня возрождения Общества работавший в должности его ответственного секретаря.

Одной из последних крупных акций, проведенных Филармоническим обществом, стал первый Всероссийский конкурс композиторов им. А.П. Петрова, организованный совместно с Союзом композиторов Санкт-Петербурга и Российским Авторским Обществом (2007).